Mapoly0018s0018



Description

MYC

Reference DB

Database ID Description
GO GO:0046983 Protein dimerization activity
OrthoMCL OG5_149804
PFAM PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain
PFAM PF14215 BHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
PANTHER PTHR11514 MYC
PANTHER PTHR11514:SF31

Nomenclature

[Notice] The nomenclature site is currently operated as a Beta version for testing.

Gene symbol Product Transcript ID Status
MpBHLH26 transcription factor, bHLH Mapoly0018s0018.1 Public
MpMYCX1 MYC transcription factor Public

Transcript models

Transcript ID Location Sequences Gene model
Mapoly0018s0018.1 scaffold_18:1223208..1229596  ( - strand ) Gene /  mRNA /  CDS /  Protein
GenBank format (with flanking bases)

Mapoly0018s0018.1  

Gene structure:

mRNA scaffold_18:1223208..1229596  ( - strand )
CDS scaffold_18:1223208..1223804  ( - strand )
CDS scaffold_18:1228008..1228868  ( - strand )
CDS scaffold_18:1229230..1229286  ( - strand )
CDS scaffold_18:1229582..1229596  ( - strand )

Sequences:

Gene

>Mapoly0018s0018.1
ATGGCTGGAATACAGGTAACCTTTTAACATTTTTCAGGATGAAGGATTGTCTTTCCCGGTTGTTTGCTGGTTGCCGCGTGATGACTTTATTTCAGTTCATGCGGTAACAGAAGTGTAGCTACCGGGGGTGTTTTTCGGGCTCAGGCTTGTTAAATATTCGCAGTGGTTGGAAAGTATTGCTGATTGTGCTAAGTAGAGGATTTCGTCTAACTTGGGCAGTTTCCGTTGCCTTTTGACTAGTCTTCTGTTCGTTGTTTCAATGCCATTGATATTGATTGGTTTAAAAGATTAGAAATTTGTGTTGTTACAGACACTCCTCTGTGTGCCGTCAAGAAGCGGAGTTGTTGAGCTTGGTTCCACTGACTTGGTAAGAGACTTCCATTACTTCTTTGTATCTTGGAATGTAAATGTAATGTCATTTGTGGCTCAATTATTGTTTGCAGCGATGCTGTGTATAAACTATAAAGTACACTTCCTCGGCCTCAATCAGTGGATGTGTTTTTGGCTTACACAGGAACTGGATACAAATTAGTTTGTTCAAGGCAGCAGGGGGATTTGCAGCAAAATTTAGCGGACCGATAGATGTCGATGTTATGTGTTCTGGGTTTGAGGCAATGCCAGTGTGCCCGGCTCCTTTTGTCTGTATCAATCAACCGGCTAACAAGAACAGAGCACACAGCCAGCTATTGTTAGTGGGCCGTGTTTGACTTATTGACATGTTGTGTTAGATTGCAGAGAACTTAGACATCATTGAAAATGTGAAGATGGTGTTCTGTGACATGGGTGAAAGCAATTGCAACTCCCAGGCAATTATACTGAATGAAGACTCGGCCTTTCTCCCCTGCCCTGCGAGTCCTTCATTGGGTAGCATACATGGGTCCACGAGGCACCTGTTACTAGACAGAGGGCCAGACGCTAGTTCGTCATTCAGGCCCATTCACCTGGACAAGATGAATTCATCAGTTTGTACGAATGTGGATTCATTCGATTATCTCTTTTCCGAGGATTTTGCTTTTGGTGATGTTTCAATTGATAATGAGAAGGAGCTTCAAAGTGCCAGTACTTTTACCGGGTCTTACCGAGGCAAAGTATCCTGTCAAGAGGATAAAATTTCGTCAGTTGGAATTGCTAAGAAGTCGCTACCTGCAGGGCAAGCGCAGAACCTTACTCGTGGCATGGAGACCGGAGAAATCTTGAATCCTCCAGAACTCAGACAGGGTAGAGACATTTTGCAAGTGAATGACGTCGCAAGTACTCGTATAAAAGAAGAAGGGACCATCAAGACTTCGAAGCACAAGCTCTCCTCATCTCTGAAATCTCAACATCCAGAAGGGATTGGCACACTTGGTAGCGCTTACGTTCGCTCCAGTATTGAATCTGAACAGGATATTGATTCAGAGGCAGAAGTCTCATATAAGGAAGTCGAATGTAGTTTCACTGTGGGACAGAAGCCTCCGAGAAAGCGTGGAAGGAAGCCTGCCAACGATAGGGAGGAACCATTGAATCATGTTCAGGCTGAGCGTCAAAGACGAGAGAAACTCAATCAACGTTTTTACGCCCTGCGGTCTGTTGTACCAAATGTCTCAAAGGTGATCTTGTATTGTACTGTCTTCTTTGTAGTGTATCCAAGTGAGGCGACTAAAAGACTAGTAACGGAATTATGAAGGGAATCCGTCTCTCCTTGTAACGTTCCCGTCCTGAGTTGGTAAAGCACTTTAAGCAGATAGCATAGAAAAGGCGGGATCTTTCTCATTTTTTCTCCCTGGTCCTTGCACTCTTCTCCGAGTGTTTGATAATAATCGAAAGGGGTATTAGAGCCAACAGTAGATTGAATAACATCTCGGAGCTTTCCTTCTCTTCTTCAGGGTTTTCAGGACCTTTCATTCAGAACTCATGATGGTGATCACTGATGGTTTGGATTTGGACAAATTCGTTACATTCGGTGCTACCTTCTGATAGAAGGTGTATTGTATTTCCTGTAGTTTGTTATCCGTTGTTTTAGATGCTTTTCCCAGTATTGCGACGTGTGTGTCATCCAACCTTACATAGTCATTACTCTCTTAAACTCATATGGCGTTGTGAAGGTGCGACCGACGAGTTTTGATGTGAGTACAGTATGTTTATAGGTTTTCTGCCCTGTACATCCGGTTTCAACTTATTTTGACTTTTGTACTCGTAATATGTCTTGGCTGCTTTTGGGCATTATAGTTTAGCTATGTTCAACGATTAGTCTTTTGGTCCTTGGGAATGGAGCTTGTGTTGCTTTAATTGGATCGTTATATCGTTTTCTGATATACCCCTAACAAGCACTACATATCTATCTTTTGTAGATTGATATTTCCGGCATCGCATAAGTAGATAGCGTCTTGTAATGAGCTGCTGAAATTATTGGGGAGGGTTCACTTCATCAACAGAGGCTGTAGGTTTAATGTTTTGTATCCCCGTAATGTTTGTAATGCCTCTTTCACCTTTGTCTAAATCCCGGCCGTTCTTCCTTTTCTGCTCTCAGAGGGACATGCATTCTCTCAGCGTGCTGTATCTTCATTGTTAAACCGCATTTGCAAGTAGTTGAAGATATTGGTCAGGGGATCCGTTTGTGCTCAGTTGACTGCACCCTACAACCTGTGATCTTTGCCGATGACATTCTGCAGAAGCTCCAGGAATTGATCACATCCACCAAAACCCGGTGTGATATGTGGGTCATGGAGGAAACTGTGCAGAAATGCGGAGAAAATTGTGCAGGAGTATTTTCAGTGATGGCAATTAGTAGATGTGTGCTGGGCAAGAGATACTCTCGGTGTCCGCTAATACGTACTTGAATTTGAAAAGTCAGAAGATTGTACGGATGGACACTACATGCAGAAATCCTCAGAAACGCGCACGAACAGGTCAATTGCATGACCAAGTTCTCCCTGTGGTCTTTTACTAAGTCTATGGAGTACATCAGGACATGCAGCCGTAGTATGGAAACTTTCAGTTTTCAACGTCCTCCGCCGGAAGCAGTGCATGAAAGCTTTCGCGCTATGGTTGTCACACCCAAATAAACGGCTCAGTTGATAGGGAGATTGGTGCAGGGATGAACTCTTCTTGAAGTTTGTGGAGATACTTTTAAGCTGATGTGGAGACCACGGTAGCACCATATGTCATCTTACCCATACCTTCGATTTTATCGGAAGATATTTGGACTTGCAAAAGAGAACGGTGACCTGCTCAGCGTTGGTTGAATCACTGCATACTGAAGGTCACCGTTCTAATTGGACCTGCTGAGATAAAAAAGCCAGCGGTCCAAGTGGCAGTCGTGGTAAATCAGTCGGACGTATGGAGGATGTAGTCGAGGGAAGACAGTCCTGCAATTACCATCAACAATACTTGAACCCTTCAGTGAACGGGAAAGCCAAACGGGAATCAATAGGTGAACGGGAAGCGTCACATTCCCGCAAGTTACCTTACACACGTCGGGGAGCTTGTTGACAATTTCGTCCTCTAGCTGTGTTCGTCGTCTAGTTTCCTTCCTTCCTAATCATGGCTTTCAGACGCACTTTTCTGTATTTCGGTGATCATGTGGAGTCCTTGTTTTCAGAACTTTATGCATTCACGGATTCCTTTTCTTCTGAAGGCTCCCCTTTTCTGGATGGTGTTTATATTCAAATATGGTTTTCCATGGTGTTCACTTACGGTTGATTTCACTCCAATGGCATTCTTATCCATTCATGATGGTTTTCACTCTTATTTGATTTCTCTAAGTTTTATGTTATTTCACTATTCTGTATGTCCCTGTCTTCTTTTACTTACAGCATGGATGTGCTAGGATGTGTTGGACATAGGTTTGAACCAGAGTTTTCACTTTGGTTTGTTGGGCTTCGAGTTCTTTAAAGATCCTGCGCGGTAAAGTAGGATTAGGGTTTAGAAGCCTATGCACCTCGGTATCTACTGATGAAGCTGGTTAGTCCGTTAGTCTAAGTGACGGGAATCTGACGCTTTGCGTTTAAATATCGTTGATGATCACTGGATGACTGTTTCCTGTCGACTAGATCCTCGACTCGGCACAATAAACTATTCACCACTGTCACGTGGACAGCTGGACTTCTCCGTATATTCCACCGCTTTACAAATTCTGAGCTCTTCTGAATCATGCATCGGTTTGTCTTGACTCCTTGCTATGTATCGCAGTTCGTCCCCTCCATTGAGACGCAACCACCTAGATTAGCGTTGCATCGTTCTCTTACATTACAAGCCCTTGCGGCTTCTAATGTACCCTTGTGTGTGTTATATTTTCTTTTGCCAGGCTTGTCACTGGTCGCATGTTATTAGCAAATATCCAATAATACAATAGAGTGATACATTTTTTTATGTTTGTTCTTGTTGCTTTCTTTTGGCATTCGTTCTAATCAACGTTGGTTCTGCAGCTTAAAATAGGGCTTCAATGTTTTGCCACACCTTTTAAGTTTCAGTCACAGCCCCAAAGGCCCGCACTGAGTACCTGAATTCGGTCTCGCTATGTCTTTATACATCTGTATGCTTTGGCTGTTTATTAGGCCATGGCATATCCTTCAGGTTTCTGATGTCTAGGCTGTGCTATAGACTCACGTGCTGAATGTGTAGTTTGATTTCTTGTTATCTAAGATGCAGGTAACATATATATATATATATATATATATATACACACACACACAGTAATTTTCTGCGTTGATTATAGCCCCTGGATTCTACTGGTATCCATACTATTAAATCTCTAATATTTGTAATTGGGTAATTGTATGCCACCTGTTAACTCCCCTCTCCAGATTGATTGTTATTTTTTTGTGCGCTCATGTTCATTGCGTCGACGTCATCCGCATTTGGCGCTGCTTCCATCTATTCAACTTGAGGTGGACTGGATTGAAATGAATTCGTTTGCTTCGATCGTCATTCACTAGCATCGAACTGGAGTGCACGCTTTTTCCTTCATCCAAACTATTTACGAGTAGCTTACAGTTTGTCAGTTTCACGTGAGCGATAGT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mRNA

>Mapoly0018s0018.1
ATGGCTGGAATACAGACACTCCTCTGTGTGCCGTCAAGAAGCGGAGTTGTTGAGCTTGGTTCCACTGACTTGATTGCAGAGAACTTAGACATCATTGAAAATGTGAAGATGGTGTTCTGTGACATGGGTGAAAGCAATTGCAACTCCCAGGCAATTATACTGAATGAAGACTCGGCCTTTCTCCCCTGCCCTGCGAGTCCTTCATTGGGTAGCATACATGGGTCCACGAGGCACCTGTTACTAGACAGAGGGCCAGACGCTAGTTCGTCATTCAGGCCCATTCACCTGGACAAGATGAATTCATCAGTTTGTACGAATGTGGATTCATTCGATTATCTCTTTTCCGAGGATTTTGCTTTTGGTGATGTTTCAATTGATAATGAGAAGGAGCTTCAAAGTGCCAGTACTTTTACCGGGTCTTACCGAGGCAAAGTATCCTGTCAAGAGGATAAAATTTCGTCAGTTGGAATTGCTAAGAAGTCGCTACCTGCAGGGCAAGCGCAGAACCTTACTCGTGGCATGGAGACCGGAGAAATCTTGAATCCTCCAGAACTCAGACAGGGTAGAGACATTTTGCAAGTGAATGACGTCGCAAGTACTCGTATAAAAGAAGAAGGGACCATCAAGACTTCGAAGCACAAGCTCTCCTCATCTCTGAAATCTCAACATCCAGAAGGGATTGGCACACTTGGTAGCGCTTACGTTCGCTCCAGTATTGAATCTGAACAGGATATTGATTCAGAGGCAGAAGTCTCATATAAGGAAGTCGAATGTAGTTTCACTGTGGGACAGAAGCCTCCGAGAAAGCGTGGAAGGAAGCCTGCCAACGATAGGGAGGAACCATTGAATCATGTTCAGGCTGAGCGTCAAAGACGAGAGAAACTCAATCAACGTTTTTACGCCCTGCGGTCTGTTGTACCAAATGTCTCAAAGATGGATAAAGCATCCCTACTTGGTGATGCTATCGCGCACATTCAAGAACTCCATTCCAAGGTTCAAGAGATGGAGTTTCAGATCAAAGGACTCGAGGCACAAGCGAAACTATTAATGGAGAAGTCCGCTGACCCGGAAAGTTCGAGGCAGTGTTTTAACAATGGCTCCAGGGAGTATTTACATCCATCAACAGTTCTTACTGGAACCTCAGCTTCTTCTGCATCAAGAATATCTATGGATGTTAAGCCAACCATCGCCGTGCATACGTTGGGGCACGAGGCTATGATTCGTCTACATTGTATGAAAGAGTCGTACGCGCTAGCGAACTTGATGTTTACCTTGGAAGAACTGAAGTTGGAGGTTCAGCATGCTAATCTCTCAATTCTTGAAGACTCGATGGTCCACATTATCCTTGTAAAAGTAAGTTTTGTTTACCTGAGGTCCGTAAAGTTTTTTGTTTGCTGCTTCTTTTATCTGAAAGGTAGAAAAAATGTTATATCGAGTAGTTGGGAAGATGGATTAGACTTTACGCGTTCTGGTATTCACTCTTCTGTCAATTGGCCTGTGGTCTTGAGCCGCATTTATGTGAACGTTTAA

CDS

>Mapoly0018s0018.1
ATGGCTGGAATACAGACACTCCTCTGTGTGCCGTCAAGAAGCGGAGTTGTTGAGCTTGGTTCCACTGACTTGATTGCAGAGAACTTAGACATCATTGAAAATGTGAAGATGGTGTTCTGTGACATGGGTGAAAGCAATTGCAACTCCCAGGCAATTATACTGAATGAAGACTCGGCCTTTCTCCCCTGCCCTGCGAGTCCTTCATTGGGTAGCATACATGGGTCCACGAGGCACCTGTTACTAGACAGAGGGCCAGACGCTAGTTCGTCATTCAGGCCCATTCACCTGGACAAGATGAATTCATCAGTTTGTACGAATGTGGATTCATTCGATTATCTCTTTTCCGAGGATTTTGCTTTTGGTGATGTTTCAATTGATAATGAGAAGGAGCTTCAAAGTGCCAGTACTTTTACCGGGTCTTACCGAGGCAAAGTATCCTGTCAAGAGGATAAAATTTCGTCAGTTGGAATTGCTAAGAAGTCGCTACCTGCAGGGCAAGCGCAGAACCTTACTCGTGGCATGGAGACCGGAGAAATCTTGAATCCTCCAGAACTCAGACAGGGTAGAGACATTTTGCAAGTGAATGACGTCGCAAGTACTCGTATAAAAGAAGAAGGGACCATCAAGACTTCGAAGCACAAGCTCTCCTCATCTCTGAAATCTCAACATCCAGAAGGGATTGGCACACTTGGTAGCGCTTACGTTCGCTCCAGTATTGAATCTGAACAGGATATTGATTCAGAGGCAGAAGTCTCATATAAGGAAGTCGAATGTAGTTTCACTGTGGGACAGAAGCCTCCGAGAAAGCGTGGAAGGAAGCCTGCCAACGATAGGGAGGAACCATTGAATCATGTTCAGGCTGAGCGTCAAAGACGAGAGAAACTCAATCAACGTTTTTACGCCCTGCGGTCTGTTGTACCAAATGTCTCAAAGATGGATAAAGCATCCCTACTTGGTGATGCTATCGCGCACATTCAAGAACTCCATTCCAAGGTTCAAGAGATGGAGTTTCAGATCAAAGGACTCGAGGCACAAGCGAAACTATTAATGGAGAAGTCCGCTGACCCGGAAAGTTCGAGGCAGTGTTTTAACAATGGCTCCAGGGAGTATTTACATCCATCAACAGTTCTTACTGGAACCTCAGCTTCTTCTGCATCAAGAATATCTATGGATGTTAAGCCAACCATCGCCGTGCATACGTTGGGGCACGAGGCTATGATTCGTCTACATTGTATGAAAGAGTCGTACGCGCTAGCGAACTTGATGTTTACCTTGGAAGAACTGAAGTTGGAGGTTCAGCATGCTAATCTCTCAATTCTTGAAGACTCGATGGTCCACATTATCCTTGTAAAAGTAAGTTTTGTTTACCTGAGGTCCGTAAAGTTTTTTGTTTGCTGCTTCTTTTATCTGAAAGGTAGAAAAAATGTTATATCGAGTAGTTGGGAAGATGGATTAGACTTTACGCGTTCTGGTATTCACTCTTCTGTCAATTGGCCTGTGGTCTTGAGCCGCATTTATGTGAACGTTTAA

Protein

>Mapoly0018s0018.1
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MarpolBase: Marchantia Genome Database / Genome Informatics Laboratory, NIG. <mpgdb'@'ynlab.info>