Mp4g02320
Description
Annotation
| Database | ID | Description |
|---|---|---|
| MobiDBLite | mobidb-lite | consensus disorder prediction |
| PANTHER | PTHR19332 | PEROXISOMAL MEMBRANE PROTEIN PEX13 |
| KEGG | K13344 | peroxin-13 |
| MapolyID | Mapoly0080s0067 | - |
| GO | GO:1990429 | peroxisomal importomer complex |
| GO | GO:0016560 | protein import into peroxisome matrix, docking |
| GO | GO:0005778 | peroxisomal membrane |
| GO | GO:0005777 | peroxisome |
| GO | GO:0016020 | membrane |
Nomenclature
| Gene symbol | Product | Transcript ID | Status |
|---|---|---|---|
| MpPEX13 | PEX13, Receptor docking | Published |
Associated Literature (AI-based literature mining, Beta-version)
PEX13, Receptor docking; Receptor docking (from nomenclature)
0 core 1 peripheral
Goto-Yamada, S., et al. (2022)
· Frontiers in Cell and Developmental Biology review citation background
M. polymorpha PEX13 (peroxin/peroxisome biogenesis)
Single-cell expression scRNA-seq atlas from Wang et al., 2023
Expression of Mp4g02320 across the single-cell RNA-seq atlas. Cluster identities (right) annotate the same UMAP used for the feature plot (left).
Gene structure:
Sequences: |
Gene UTR + CDS + intron |
| >Mp4g02320.1 GTGGTCCCTC GGGGACTCTC GACGACGACG GGCAGCAGCG CCAGCGAGCG AGCGAGGCAT CGAGAGATCG ACAGACAGGT CGCTCGTCGC TGTTCAATCC TGTCTAGCCC ATCTCCGTAA GCGCGCGCTG CCGCGGCCGC TTTTCTGCCC GTGGTTTCAG GACGACATTC GCTCATTCAC GCAGGCTTGA ATCGAATTCG GGAGGATTCC TTGCAGAGCT CGGAGAGGGA CAGATTTTTC GGATTTGGGG TCGTTGTCAG AGCTAATAGA GACGAAGGAA GAAGGGAAGA AAGGGAGGAA GGGGTTGCTT ATTACCCTAT GGATTGCCGG TGAGGAAGTA CCGCGGAGGC AGGCATTAAT TGGGGATGGC TACTTCAGGT GAGGTTTCGA TTGTGGAAAG ATATGGCGGA TGGATGCTTC CTGTTGATGG ATTTTGTCTC GGGCTCGCTG TTGAGTGCTT GGTTGTGGCG ATTGCTGCTG CGTCTGTATG GGAATGGTTT GTCAGTCGAT CGAATTGTTG GGAGGCAGGC ACTCGTGCGT TGTTAGGTTT TTTTGGTTGA AGGTCTTCGC TTGACATTAC ATCCTGAGTC ATCCTGAGTC ATCGGTCGAC ACGATCAGGG TAGATTCAGT TGTGTTCCGG CTTATTCTGA ACGTGGAGTA CACTGAAGCA AATGAAGACC GAATGTATTC TGGGCTGCGT TTAGAGTCCG AATTCGCATG CGAAGTGTAC ATGCATGCAA CTGATTGCAC AGCTTAGCAC ATTTTCCCTT GTCAGGAGTT CATGGGCATT ATCGTACCGT CGGTCGGTGG AGTGGTGATA TTTCTTCATC TGGTTACGTG ACGAGCTGAA TTGGAATCTG TACGTTTCCA ATTCAGCTCG GATTACACGG ACAGTTGTGG TCATTCTTCA ATCAGTAACC TAGAATTATA GGGTTGAAGA ATGACCTTAA CATGACTCAT GACCCTATGT TGAGCTTCAG CTGGTGATAG TATGATAAAT TACACCGTCC AGTCTATCAA TGAACTAAAT TTTAGTCCTG CATTGGCGGC ATTTGCTCAT GTCCGTAGAG CCTGTGGATC AACAGACCCG AGGATTCGAT TTGGTCAAGT GTTGATATTT CTGTTAATGA ATGATGTGTC AAGCTGTGAG TTTTATATAA TAGTCTTCTT GCTGTTCCTT AAGGCACAGA GACTGGACTC TTGTATTTGT GCGTACTGCT CAACAGAGCG CGCTCGCTTT TAGTCTTCTT GTCTATGCAC CGCTATTCTG GGTGTGACAA TTTTCCGTGA GTTTTCTGAT GTTTTTGCGT TTGTAAGAGT CTCTTGTACT GACAGTTGCC GTTGCTTATT GTATTGTGTT CAGGGCGGTC AGCTCCACCA CCTAAGCCCT GGGAGCGAGC TGGCACATCC GCTGGAAGTA GTGGGCCTTC TCCCTTTGCT CCTGCGTCAA ACACCAACAG CACCGCAGCG ACGGTAGCAT CGTCAGGAAC AGCCACCAGT GAAGCACAAA AGGAGGAGGT CGCTAGGAAT GCACAGAATG GAAGTGGTAC TGCAGTTGGG CGGCCTATGC CTCCTAGACC TTGGGAGACA AATGGCACTA CCGGTAAGCA GATGAAGCTA GCCAAAGCTT ATGGGTTTCT GGTGATATTG CAATCTCAGG ACTCAGAAGT ACCGTCGATT AGGATCACCG CAGAAGCAAT CGTTTCTGGC CACACGTCAG GATGACTTAG CATCGATTGT GTCATTGATA GAATGGCAGA TTAGAAGAGC AGCTTAACGA AAGAGAAGAT AAATACTGAG TGCCGAGAGT CAGCGGTTCA AGTCCGTAAT TACCCAAGGG TTTCAAGGGT GTAACATAGA TCATCGTACT TTCACTGAGT TTGTGAACAG AATTTCTCTT GAAGCTGGTT TTGAAGTCTC TTATTTATTT GTGAGAATCA TTTGTAGTTG TCGACGTGCC ACCTGGTTCA GTGAATGCCG CCAGCTATGT CTTAACACGA CGTTGATTGA GTTTTAGGAA TCTGTTCTGT CTTTAATCTG TTGGTTTTTG TAAATGCTCA AATGACCTGG GTTGATTGCC TCACCACAGC AAACTTATTG GCATGCAATG GATTTTGACC TCAGCAGGAT ATGGCACCGG TGGTTACGGT ACCGGCACAA TGAGTTCATA CAATCGAATG GGCTATGGCA GTACTGGCTA CGGAGGTGGT GGTATGTACG GAAGTAGCTA CGGGAGCACT GGATATGGAA GTGGCGGGAT GTATGGAAGC AGCCTTGGCG GGATGGGTGG TTATGGAAGC GGAAGTATGT ACGGGGGTGG TGGTTACGGG TCAAGTATGT ACGGTGGTGG AATGTATGGA AATAGATATG GCGGAGGGAT GGGAGGCATG GGAGGTATGG GAGGCATGGG TGGGTACGGA ATGGGTGGTA TGGGAGGAGG GTATGGAATG GGCGGTATGC CAGGCGATCC GAACAATCCC AATGGAGAGC CACCTCCTCA AGCTCCCGGA TTTTGGATCT CAATGCTTCA AGGGGTAAGA CCATTCTTGA GTAGTTCACG TCCACGAACT GTATACAACC ATAAGGTGTT TATTTTAGGA TTTTGAGTAT CAGAAGCTTT CACCCGATAC TGAATCAAAA CTTTGTTATA ATATAGTTCT TTTCAAACCA TGATCAGTTC CTGATGTTTA TATCGATCAA GATCATGAGA TAATTAATTT AGAGATTGGC ACCGAACTTT TTGGTTGTGT GAAGACAGTT TGATAAGTTG TTAGATAAGG TCAAGCGGAT TATTTAAATT CTGACTTAAG AAAGTTTGTC TTATCCTGAT GAAGTTTGAG GGTCCCTTAA AAGGAGAGTA GCTGTGGAAT GGTTGTCACT CATTTGCATC TTGAGGGAAG GATGTGATTA CTGAATCCTG TTTTTCTTCG GTTGGCAGTT GCAAGGTGTG ATGCACTTCT TTGGGCGCCT TTCAATCCTT GTGGATGAGA ACACTCAGGC ATTTCACTTC TTTATTACAG CTCTCCTCCA GGTGAGAAGA AACTGAAAAA CTCGTTTTTT AAATATAAGC TTTCGAATGG CAGCAATATC TATCTGACAA AAAGGTTGCC ACGCTTTGTC ACATGTGGGA TTTGTATGTC CAGTATTTTG TTGCCGGGAT TTTCATTGAG AAGGTATTAT AGTTTCTTAC CTGATGGGAT TGTTTGGCAG CTTTGTGATC GGGCTGGAGT GCTGTATGGT GAGCTTGCTC GGTTCGTGCT TAGATTACTT GGGTTCCGGA CTGGTGCGAA AGCACGAGCT CGTTCGAAGG CAGCTGCTAG AGCTCTTGAG GGTGGAGACA TGCACCCAGG GCACCCAGGG CACCAACCTG GACAGGATAT AATTGTCAAA CCTAACGCTC CGGAGCCGGC ATGGGACAAT ATGTGGCCAG ACAACGGGCC ATCCTCGTAA TCCACCGTCC TACTGTCTTC ATGACTACAA TACACTCTTC TTGGAGCCCT CATTTTCTCG AATCGAACAG GCTGTTACGG TTTCTCAGAG CGGACTGTGC CATCTATTTT CTAGATGTAG CCTTGCTACG ACTGAATGAG ATCAAATGGT CAGTTTGGTG GGTCAAGACC GATCTTCAGC AAATGCAAGC AAACGAAGGA GAAAATATGC GAATTGCTGT ATCGGAAGCA GATTCTTGAA TCGGACCCCG TCGCTCATGT AGCTTTGAGT CACAGGGTAC TTGATTTGTA ATTTAGTACG GGAGGTTTTG AGGATGTTCT TTAAAACCTT AGGTTGATCG AAAATTATAA TCGATTGATA TAATTTATTA GCTAGATGTA TGCAGCAGTC CTATTGTTTG TGACAGTCTA GTGGTTGGGT GGTTCTTAGC CCCTTGGTGG TTAGGTTGTA TATGATGAAC ATGAGAACTT TAGCTTTATA ATCGATTGCT ACTTGCAAAT TTGTGCTTTG AGTAAATCGT CTGCTATCCA CTTGCTGTAG AAAGTCAGGT CAGGGAATCG AAAAGTACAT TGCTTAGGCT TAAGATTGTC GCTAGAAAGG TACCGTAGAC GTCTCCAGAA TAAGATTGTT GTGCACGTTA GAGGTGAATA TGACGTGTCT TGTGGCTCCT ATATAAAACA TCCTAGTGGA TGCCAGCTCC AGCGAACGCC AGCTCAAGTT TGTGATGTCC TTGTTTG |
mRNA UTR + CDS |
| >Mp4g02320.1 GTGGTCCCTC GGGGACTCTC GACGACGACG GGCAGCAGCG CCAGCGAGCG AGCGAGGCAT CGAGAGATCG ACAGACAGGT CGCTCGTCGC TGTTCAATCC TGTCTAGCCC ATCTCCGTAA GCGCGCGCTG CCGCGGCCGC TTTTCTGCCC GTGGTTTCAG GACGACATTC GCTCATTCAC GCAGGCTTGA ATCGAATTCG GGAGGATTCC TTGCAGAGCT CGGAGAGGGA CAGATTTTTC GGATTTGGGG TCGTTGTCAG AGCTAATAGA GACGAAGGAA GAAGGGAAGA AAGGGAGGAA GGGGTTGCTT ATTACCCTAT GGATTGCCGG TGAGGAAGTA CCGCGGAGGC AGGCATTAAT TGGGGATGGC TACTTCAGGG CGGTCAGCTC CACCACCTAA GCCCTGGGAG CGAGCTGGCA CATCCGCTGG AAGTAGTGGG CCTTCTCCCT TTGCTCCTGC GTCAAACACC AACAGCACCG CAGCGACGGT AGCATCGTCA GGAACAGCCA CCAGTGAAGC ACAAAAGGAG GAGGTCGCTA GGAATGCACA GAATGGAAGT GGTACTGCAG TTGGGCGGCC TATGCCTCCT AGACCTTGGG AGACAAATGG CACTACCGCA GGATATGGCA CCGGTGGTTA CGGTACCGGC ACAATGAGTT CATACAATCG AATGGGCTAT GGCAGTACTG GCTACGGAGG TGGTGGTATG TACGGAAGTA GCTACGGGAG CACTGGATAT GGAAGTGGCG GGATGTATGG AAGCAGCCTT GGCGGGATGG GTGGTTATGG AAGCGGAAGT ATGTACGGGG GTGGTGGTTA CGGGTCAAGT ATGTACGGTG GTGGAATGTA TGGAAATAGA TATGGCGGAG GGATGGGAGG CATGGGAGGT ATGGGAGGCA TGGGTGGGTA CGGAATGGGT GGTATGGGAG GAGGGTATGG AATGGGCGGT ATGCCAGGCG ATCCGAACAA TCCCAATGGA GAGCCACCTC CTCAAGCTCC CGGATTTTGG ATCTCAATGC TTCAAGGGTT GCAAGGTGTG ATGCACTTCT TTGGGCGCCT TTCAATCCTT GTGGATGAGA ACACTCAGGC ATTTCACTTC TTTATTACAG CTCTCCTCCA GCTTTGTGAT CGGGCTGGAG TGCTGTATGG TGAGCTTGCT CGGTTCGTGC TTAGATTACT TGGGTTCCGG ACTGGTGCGA AAGCACGAGC TCGTTCGAAG GCAGCTGCTA GAGCTCTTGA GGGTGGAGAC ATGCACCCAG GGCACCCAGG GCACCAACCT GGACAGGATA TAATTGTCAA ACCTAACGCT CCGGAGCCGG CATGGGACAA TATGTGGCCA GACAACGGGC CATCCTCGTA ATCCACCGTC CTACTGTCTT CATGACTACA ATACACTCTT CTTGGAGCCC TCATTTTCTC GAATCGAACA GGCTGTTACG GTTTCTCAGA GCGGACTGTG CCATCTATTT TCTAGATGTA GCCTTGCTAC GACTGAATGA GATCAAATGG TCAGTTTGGT GGGTCAAGAC CGATCTTCAG CAAATGCAAG CAAACGAAGG AGAAAATATG CGAATTGCTG TATCGGAAGC AGATTCTTGA ATCGGACCCC GTCGCTCATG TAGCTTTGAG TCACAGGGTA CTTGATTTGT AATTTAGTAC GGGAGGTTTT GAGGATGTTC TTTAAAACCT TAGGTTGATC GAAAATTATA ATCGATTGAT ATAATTTATT AGCTAGATGT ATGCAGCAGT CCTATTGTTT GTGACAGTCT AGTGGTTGGG TGGTTCTTAG CCCCTTGGTG GTTAGGTTGT ATATGATGAA CATGAGAACT TTAGCTTTAT AATCGATTGC TACTTGCAAA TTTGTGCTTT GAGTAAATCG TCTGCTATCC ACTTGCTGTA GAAAGTCAGG TCAGGGAATC GAAAAGTACA TTGCTTAGGC TTAAGATTGT CGCTAGAAAG GTACCGTAGA CGTCTCCAGA ATAAGATTGT TGTGCACGTT AGAGGTGAAT ATGACGTGTC TTGTGGCTCC TATATAAAAC ATCCTAGTGG ATGCCAGCTC CAGCGAACGC CAGCTCAAGT TTGTGATGTC CTTGTTTG |
CDS |
| >Mp4g02320.1 ATGGCTACTT CAGGGCGGTC AGCTCCACCA CCTAAGCCCT GGGAGCGAGC TGGCACATCC GCTGGAAGTA GTGGGCCTTC TCCCTTTGCT CCTGCGTCAA ACACCAACAG CACCGCAGCG ACGGTAGCAT CGTCAGGAAC AGCCACCAGT GAAGCACAAA AGGAGGAGGT CGCTAGGAAT GCACAGAATG GAAGTGGTAC TGCAGTTGGG CGGCCTATGC CTCCTAGACC TTGGGAGACA AATGGCACTA CCGCAGGATA TGGCACCGGT GGTTACGGTA CCGGCACAAT GAGTTCATAC AATCGAATGG GCTATGGCAG TACTGGCTAC GGAGGTGGTG GTATGTACGG AAGTAGCTAC GGGAGCACTG GATATGGAAG TGGCGGGATG TATGGAAGCA GCCTTGGCGG GATGGGTGGT TATGGAAGCG GAAGTATGTA CGGGGGTGGT GGTTACGGGT CAAGTATGTA CGGTGGTGGA ATGTATGGAA ATAGATATGG CGGAGGGATG GGAGGCATGG GAGGTATGGG AGGCATGGGT GGGTACGGAA TGGGTGGTAT GGGAGGAGGG TATGGAATGG GCGGTATGCC AGGCGATCCG AACAATCCCA ATGGAGAGCC ACCTCCTCAA GCTCCCGGAT TTTGGATCTC AATGCTTCAA GGGTTGCAAG GTGTGATGCA CTTCTTTGGG CGCCTTTCAA TCCTTGTGGA TGAGAACACT CAGGCATTTC ACTTCTTTAT TACAGCTCTC CTCCAGCTTT GTGATCGGGC TGGAGTGCTG TATGGTGAGC TTGCTCGGTT CGTGCTTAGA TTACTTGGGT TCCGGACTGG TGCGAAAGCA CGAGCTCGTT CGAAGGCAGC TGCTAGAGCT CTTGAGGGTG GAGACATGCA CCCAGGGCAC CCAGGGCACC AACCTGGACA GGATATAATT GTCAAACCTA ACGCTCCGGA GCCGGCATGG GACAATATGT GGCCAGACAA CGGGCCATCC TCGTAA |
Protein |
| >Mp4g02320.1 MATSGRSAPP PKPWERAGTS AGSSGPSPFA PASNTNSTAA TVASSGTATS EAQKEEVARN AQNGSGTAVG RPMPPRPWET NGTTAGYGTG GYGTGTMSSY NRMGYGSTGY GGGGMYGSSY GSTGYGSGGM YGSSLGGMGG YGSGSMYGGG GYGSSMYGGG MYGNRYGGGM GGMGGMGGMG GYGMGGMGGG YGMGGMPGDP NNPNGEPPPQ APGFWISMLQ GLQGVMHFFG RLSILVDENT QAFHFFITAL LQLCDRAGVL YGELARFVLR LLGFRTGAKA RARSKAAARA LEGGDMHPGH PGHQPGQDII VKPNAPEPAW DNMWPDNGPS S |